El Museo de la Ciudad se ubica en el edificio patrimonial de más de 450 años donde funcionaba el antiguo Hospital San Juan de Dios. Está ubicado en la calle García Moreno y Rocafuerte. Se reconoce como un museo de historia y memoria social. A través de sus investigaciones, exposiciones y programas educativos, busca promover reflexiones sobre diversas problemáticas sociales del DMQ y poner en tensión estructuras coloniales arrastradas por siglos, abogando por difundir historias no contadas y con enfoque de género, en procesos de diálogo con colectivos académicos y comunidades diversas. Contamos con áreas gratuitas en donde se incluyen exposiciones temporales, el huerto y la biblioteca especializada Andrea Moreno Aguilar. También contamos con la exposición permanente, área pagada, en donde dialogamos sobre las memorias y los procesos históricos desde los primeros habitantes de este territorio hasta el Siglo XX.