El Museo Jacinto Jijón y Caamaño es un espacio interactivo, que expone alrededor de 1200 bienes culturales organizados temáticamente en base a las investigaciones realizadas por Jijón y Caamaño en el campo de la arqueología, la antropología, el arte y la historia, a inicios del siglo XX. El museo está organizado en dos pisos, el primero dedicado a una visión cronológica del territorio ecuatoriano, considerando los lugares donde investigó y excavó Jacinto Jijón y Caamaño, en la sierra ecuatoriana y en la provincia de Manabí en el litoral. Además, presenta un pequeño fondo etnográfico procedente de culturas que habitan en la amazonia ecuatoriana, coleccionado por Jijón y Caamaño, desde la década de 1920. El segundo piso expone su faceta de coleccionista de arte pictórico y escultórico colonial, republicano y de artes decorativas. En este caso, sus investigaciones sobre arte e historia contribuyeron al desarrollo teórico de la historia del arte en el contexto ecuatoriano.